Repousser les limites de l'IA et de la découverte de médicaments : Une conversation avec le Dr. Shiva Amiri

À l'intersection de l'intelligence artificielle, des sciences de la vie et des femmes dans les sciences se trouve le Dr Shiva Amiri, scientifique, technologue, vice-présidente, responsable de l'IA et de l'intelligence des données chez Pivotal Life Sciences et membre du conseil d'administration de Computing for Humanity. Avec une carrière étendue couvrant le monde universitaire, l'innovation technologique et la santé mondiale, le parcours de Shiva illustre la façon dont l'IA transforme la découverte de médicaments et les soins de santé, tout en soulignant l'importance de soutenir les femmes dans les STIM.

Nous nous sommes récemment entretenus avec le Dr Amiri pour en savoir plus sur son parcours, sur l'évolution de l'IA dans la découverte de médicaments et sur la manière dont nous pouvons créer des avenirs plus inclusifs et ayant plus impactant pour la science et la société.

Une étincelle allumée tôt

"Mon intérêt pour les mathématiques et les sciences s'est éveillé avec le soutien de ma famille et de bons professeurs. J'aurais aimé être davantage exposé à l'ingénierie au lycée", se souvient Shiva. Lorsque je suis entré à l'université, c'était à l'époque du projet sur le génome humain 1999m et le premier boom du « .com » se produisait dans la Silicon Valley. Je me suis dit que j'allais avoir besoin d'ordinateurs pour la biologie".

Cette fascination précoce l'a conduite à la biologie informatique, puis à l'intelligence artificielle, où elle a trouvé une occasion unique de combiner science rigoureuse et technologie de pointe.

De l'université à l'innovation

Le parcours universitaire de Shiva l'a amenée à suivre un double cursus en informatique et en biologie humaine à l'université de Toronto. Après ses études de premier cycle, elle a poursuivi des études supérieures en recherche biomédicale à l'Université d'Oxford, y compris un doctorat axé sur la biologie informatique et la biophysique informatique. Au fil du temps, elle a commencé à combler le fossé entre la science universitaire et les applications du monde réel, en assumant des rôles de direction dans les secteurs privé et public.

Aujourd'hui, Shiva travaille à la pointe de l'innovation en matière d'IA dans le domaine de la biotechnologie, aidant les équipes à utiliser l'apprentissage automatique pour accélérer le développement des traitements et optimiser la prise de décision dans les sciences de la vie.

 Le calcul de haute performance dans la recherche

Au cours de ses années d'études, Mme Shiva a beaucoup travaillé avec des ressources informatiques de haute performance (HPC). "L'accès au calcul haute performance était essentiel pour mes recherches", explique-t-elle. "J'ai apprécié l'accès à du matériel rapide. L'informatique a vraiment progressé au cours des 20 dernières années, lorsque je faisais mon doctorat. À l'époque, si vous vouliez simuler une nanoseconde d'une protéine, cela prenait un mois sur certains des ordinateurs les plus rapides. Aujourd'hui, cela peut se faire en quelques minutes".

Elle est convaincue qu'un meilleur accès aux systèmes de calcul à haute performance peut faire la différence pour les universitaires et les chercheurs qui travaillent sur de grands problèmes scientifiques. "Nous avons besoin d'une infrastructure plus accessible et d'une intégration plus rapide. Démocratiser l'accès au calcul haute performance, comme le fait Computing for Humanity, peut débloquer l'innovation de brillants esprits qui, autrement, ne disposeraient pas des ressources nécessaires.

 Faire le lien entre l'industrie et le monde universitaire

Shiva estime également qu'il est urgent d'améliorer le lien entre la recherche universitaire et l'industrie. Certaines personnes aiment faire de la recherche fondamentale, elles ont besoin d'être soutenues par des subventions gouvernementales dans leurs universités. La recherche fondamentale et les données sont idéalement partagées et ouvertes et peuvent être validées par d'autres scientifiques. "Nous devons créer une communauté plus importante au niveau de la science fondamentale en biologie et au niveau des travaux basés sur les applications. Je pense qu'il est très important d'avoir des contrôles rigoureux, par exemple en établissant des partenariats avec l'industrie".

Le rôle de l'IA dans la découverte de médicaments

Selon Shiva, l'impact de l'IA sur la découverte de médicaments a été transformateur et continuera à se développer.    

"Traditionnellement, le développement d'un médicament peut prendre plus d'une décennie. En matière de découverte de médicaments, nous pouvons générer des tonnes de données, construire des modèles et, plus récemment, nous nous sommes orientés vers les modèles de fondation. Des niveaux de détail plus élevés sur la façon dont les médicaments, les protéines et les réseaux plus larges d'interactions dans une cellule peuvent améliorer notre compréhension des mécanismes d'action d'un médicament,      le mécanisme de la maladie, etc. Ces modèles de base sont de plus en plus avancés et c'est une période passionnante dans le domaine. L'IA nous permet de cribler rapidement les molécules, de prédire leur efficacité et même d'identifier les sous-groupes de patients les plus susceptibles de bénéficier d'un traitement", explique-t-elle.

Mme Shiva croit en l'exploitation de l'IA pour accélérer la recherche clinique, qu'il s'agisse de maladies rares ou de traitements contre le cancer. "Je suis très enthousiaste quant au rôle de l'IA dans la médecine", note-t-elle. "Il y a toujours des défis à relever lorsque l'on travaille sur des choses en cours de développement et à la pointe de la technologie. Il ne faut pas s'attendre à une situation facile.

Surmonter les défis et ouvrir des portes

Shiva a également relevé sa part de défis dans le domaine de l'IA.

Chaque fois que l'on travaille avec une nouvelle technologie, il y a beaucoup de scepticisme. Il y a toujours de nouvelles technologies, et vous devez apprendre à travailler avec elles. Votre équipe doit apprendre à l'utiliser de manière appropriée, à la tester et à l'évaluer.

Elle souligne l'importance de créer des environnements d'apprentissage qui renforcent la confiance technique des femmes et des groupes sous-représentés. "Cela commence tôt - dans les écoles, dans le mentorat, dans l'embauche. L'industrie peut montrer la voie en établissant des méthodes qui attireront et développeront les meilleurs éléments, qu'il s'agisse d'hommes ou de femmes. 

Réflexions finales

L'histoire du Dr Shiva Amiri nous rappelle que la technologie n'est pas seulement une question d'outils, mais aussi de personnes, d'équité et de possibilités. À Computing for Humanity, nous sommes fiers de pouvoir compter sur ses conseils au sein de notre conseil d'administration, alors que nous nous efforçons de démocratiser l'accès à l'IA et à la puissance de calcul pour la recherche et l'innovation.

Alors que l'IA continue d'évoluer, des voix comme celle de Shiva sont essentielles, non seulement pour faire avancer la science, mais aussi pour façonner un avenir plus inclusif et plus impactant.